时间安排 | 主要内容 | 涉及知识点(或举例) |
第一天 9.00-11.30 |
代谢组学生信分析
|
1代谢组学基本入门知识(课题设计、样品类型、所用的仪器设备、样品收集要求)
2,原始矩阵归一化处理, 3,Simca-p软件的使用 4,Pca、oplsda模型的建立、代谢物VIP值的计算 5,置换检验 6,差异代谢物的筛选、鉴定 7,HMDB、metaboanalyst数据库的使用,代谢通路富集分析 8,代谢物的pearson相关性分析 |
第一天 2.00-5.00 | 转录组学数据分析
|
1,GEO数据库的使用和芯片下载,
2,R语言做差异分子的筛选 3,PPI蛋白互做网络构建 4,富集分析 5,基因的pearson相关性分析 |
第二天 9.00-11.30 |
蛋白组学数据分析 肠道菌群课题设计+数据分析(基于云平台)
|
1,差异蛋白分子的筛选
2,PPI蛋白互做网络构建 3,富集分析 4,蛋白的pearson相关性分析 5,肠道进群入门知识, 6,课题设计 7,α、β多样性分析, 8,组间差异物种分析 9,Lefse分析, 10,功能分析 11,关联环境因子 |
第二天 2.00-5.00 |
多组学联合分析 |
6,转录组+蛋白组/代谢组关联实验 设计、分析方法及应用,
7,蛋白组+代谢组关联实验设计、 分析方法及应用 8,网络药理学和代谢组学的联合分析 9,R语言:相关性分析;在线工具:热图、火山图等常见图形的绘制 10,(转录组+蛋白关组联) 11,蛋白互作网络图、相关性调控 网络图的应用介绍 12,Cytoscape软件及使用详解 |
© 版权声明
文章均由网站用户自由创作,如有侵权请联系删除。
THE END
喜欢就支持一下吧