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前言
空间转录组课表
空间基础处理(Seurat)
空间多样本联合分析(Seurat)
空间基础处理(scanpy)
单细胞空间联合分析(Seurat)
单细胞空间联合分析(cell2location)
单细胞空间联合分析(RCTD)
单细胞空间联合分析(MIA)
空间转录组通讯分析(stlearn)
空间转录组通讯分析(COMMOT)
空间转录组轨迹分析(SPATA2)
空间转录组CNV分析(SPATA2、siCNV)
空间转录组富集分析(GSVA、包括marker的富集打分)
空间转录组高级绘图(细胞共定位、饼图、空间密度图)
空间转录组高级绘图(细胞类型方向图、区域细胞密度气泡图)
空间转录组绘图(配受体空间分布、配受体共定位、细胞定位近邻热图)
空间转录组细胞聚类
空间转录组细胞共定位
空间转录组细胞网络(cell degree)
空间轨迹(SPATA2)
空间基因开关
空间轨迹向量场
空间WGCNA(WGCNA)
空间文章复现(心脏)
空转文章复现(肝癌)
空间文章复现(心肌)
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